| Capitotricha bicolor | dlouhochlupka dvoubarvá | Lachnaceae | Ascomycota | 13.05.18 |
| Ceriporia purpurea | pórnatka purpurová | Phanerochaetaceae | Basidiomycota | 02.02.19 |
| Ceriporia viridans | pórnatka zelenající | Phanerochaetaceae | Basidiomycota | 20.04.18 |
| Ceriporiopsis gilvescens | pórnatka bledoplavá | Phanerochaetaceae | Basidiomycota | 10.02.18 |
| Ciboria rufofusca | jehnědka červenohnědá (jedlová) | Sclerotiniaceae | Ascomycota | 02.05.18 |
| Clavulinopsis helvola | kyjovečka hnědavá | Clavariaceae | Basidiomycota | 16.10.18 |
| Colletotrichum dematium | hladkoplodka | Xylariaceae | Ascomycota | 30.09.16 |
| Coniochaeta scatigena | červovka | Coniochaetaceae | Ascomycota | 20.03.18 |
| Coprinellus domesticus | hnojník domácí | Psathyrellaceae | Basidiomycota | 01.10.16 |
| Cordyceps militaris | housenice vojenská | Cordycipitaceae | Ascomycota | 27.10.19 |
| Cortinarius aureifolius | pavučinec | Cortinariaceae | Basidiomycota | 02.10.17 |
| Cortinarius diasemospermus | pavučinec meduňkový | Cortinariaceae | Basidiomycota | 02.03.18 |
| Creolophus cirrhatus | ježatec různozubý | Hericiaceae | Basidiomycota | 26.05.18 |
| Crepidotus caspari | trepkovitka hlínolupenná | Inocybaceae | Basidiomycota | 31.12.16 |
| Crepidotus crocophyllus | trepkovitka šafránová | Inocybaceae | Basidiomycota | 01.10.16 |
| Crepidotus mollis | trepkovitka měkká | Inocybaceae | Basidiomycota | 30.09.16 |
| Cucurbitaria elongata | kloubnatka akátová | Cucurbitariaceae | Ascomycota | 30.12.18 |
| Cucurbitaria spartii | kloubnatka janovcová | Cucurbitariaceae | Ascomycota | 25.02.19 |
| Cyclaneusma minus | sypavka | Rhytismataceae | Ascomycota | 13.02.18 |
| Cyphellopsis anomala | číšovec nahloučený | Niaceae | Basidiomycota | 12.03.18 |
| Cystolepiota bucknallii | bedla Bucknallova | Agaricaceae | Basidiomycota | 08.01.18 |
| Chaetosphaerella fusca | Chaetosphaerellaceae | Ascomycota | 11.04.18 | |
| Choiromyces meandriformis | bělolanýž obecný | Tuberaceae | Ascomycota | 30.09.16 |